Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJA8P48165 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA8P48165 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA8P48165 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA8P48165 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA8P48165 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms