Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms