Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CHRNA7P36544 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CHRNA7P36544 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms