Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJC1P36383 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms