Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTN2P35609 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms