Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms