Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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CASQ1P31415 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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