Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMA3P25788 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMA3P25788 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms