Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA6P23229 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA6P23229 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms