Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms