Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms