Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BRAFP15056 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BRAFP15056 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BRAFP15056 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BRAFP15056 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BRAFP15056 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BRAFP15056 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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