Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT10P13645 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT10P13645 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT10P13645 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT10P13645 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms