Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFTRP13569 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFTRP13569 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFTRP13569 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms