Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL2P13500 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL2P13500 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL2P13500 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCL2P13500 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL2P13500 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCL2P13500 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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