Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT3P12035 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT3P12035 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms