Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
VPREB1P12018 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms