Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DMDP11532 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DMDP11532 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DMDP11532 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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