Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPBO95292 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms