Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCNDBP1O95273 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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