Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRATO95237 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRATO95237 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRATO95237 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRATO95237 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRATO95237 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRATO95237 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRATO95237 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms