Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms