Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREB3O43889 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CREB3O43889 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms