Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms