Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP17L12C9JPN9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP17L12C9JPN9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms