Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRDCB7Z8K6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRDCB7Z8K6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRDCB7Z8K6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRDCB7Z8K6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRDCB7Z8K6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRDCB7Z8K6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms