Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
GGTLC3B5MD39 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms