Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GMNCA6NCL1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms