Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FRMD3A2A2Y4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms