Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP15Q9Y4E8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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