Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms