Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD1BQ9UPS6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD1BQ9UPS6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms