Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DUSP13Q9UII6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms