Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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