Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEBOXQ9HB31 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms