Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SLIRPQ9GZT3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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