Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms