Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYT17Q9BSW7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT17Q9BSW7 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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