Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TINF2Q9BSI4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms