Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SPOCK3Q9BQ16 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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