Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms