Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC4Q96FT7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC4Q96FT7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms