Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms