Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTSSAQ969W0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms