Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKD2Q969F2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms