Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms