Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATL1Q8WXF7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms