Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00612Q8N6U2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms