Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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RAB11FIP4Q86YS3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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RAB11FIP4Q86YS3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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RAB11FIP4Q86YS3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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