Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX20Q7Z614 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX20Q7Z614 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms